RSS export of vacancies - Seulement les offres à la une : No / Métier : SCIENCE - BAP A : Sciences du vivant, de la terre et de l’environnement, SCIENCE - BAP D : Sciences Humaines et Sociales / Poste ouvert aux : : Contractuels

2026-831 - H/F– Chargé de mission en appui à un observatoire Géographe/géomaticien société-environnement H/F

Mon, 05 Oct 2026 11:22:15 Z

Category : SCIENCE - BAP D : Sciences Humaines et Sociales/D2B42 - Ingénieur-e d’études en sciences de l’information géographique
Contract type : Temporary
Position description :
Sous la responsabilité du Professeur Awa Niang-Fall, la mission du (de la) VIA visera à appuyer l’équipe dans des travaux centrés pour l’essentiel sur la connaissance des changements environnementaux et sur la cartographie des risques affectant les socio-écosystèmes du littoral sénégalais. Beaucoup de ces travaux consistent à produire des indicateurs et des cartes qui concourent, entre autres objectifs, à la construction d’un observatoire national du littoral, avec pour finalité d’aider à la mise en œuvre et au suivi des politiques publiques nationales et territoriales d’aménagement des zones côtières, incluant la gestion des enjeux touristiques. Ces travaux s’inscrivent par ailleurs dans différents projets internationaux et nationaux qui permettent l’accès à des financements (WACA-VAR : volet recherche du West Africa Coastal Areas Program ; Observatoire National du Littoral au Sénégal). Le rôle spécifique du VIA consistera à dispenser un appui méthodologique et technique, tout particulièrement aux stagiaires et doctorants : guidage/aide à la manipulation des outils SIG, traitement des images de télédétection/drones, gestion et traitement de données d’enquêtes. Cet appui pourra se dérouler sous forme d’une assistance apportée à des sessions de formations, lesquelles seront dirigées par un spécialiste senior. Le ou la VIA participera aussi à certaines actions de recherche : ateliers de projets, collecte de données sur le terrain, alimentation d’une plate-forme d’information. Dans la mesure où la participation aux travaux de recherche sera effective, le (ou la) VIA pourra participer à la valorisation scientifique et être reconnu(e) en tant que co-auteur de certaines publications du Laboratoire. Par ailleurs, le ou la VIA contribuera aussi à créer les conditions d’un bon fonctionnement du laboratoire dans son ensemble, en s’impliquant dans des activités d’animation telles que l’organisation de réunions et séminaires (« journées doctoriales » annuelles) et en réalisant des tâches d’administration (ex. : définition de commandes, préparation de la mise en place de contrats, ...) sous la supervision de la responsable de laboratoire et en relation avec l’administration du Centre IRD de Dakar.

Master 2 ou Ingénieur, en géographie, géomatique, géomorphologie, environnement, agronomie, économie, avec bonnes compétences SIG. Vous avez développé les compétences suivantes : · définir une enquête, la conduire, organiser le stockage et le traitement des données collectées · utiliser des images de télédétection et drones · combiner des données d’enquêtes avec des couches spatiales, en produisant des restitutions de type carto statistique ou carto thématique avec des logiciels SIG appropriés (type QGIS) · rédiger une méthodologie · valoriser des résultats en produisant des analyses rédigées, avec l’aide des chercheurs et enseignants-chercheurs Vous faites preuve des qualités humaines suivantes : · capacité à s’intégrer dans une équipe multiculturelle et multidisciplinaire · intérêt pour les cultures et savoirs d’origines diverses · intérêt pour le terrain et pour le contact avec des populations villageoises (paysans, pêcheurs..) · capacité à interagir sur place puis à distance avec des missionnaires de plusieurs disciplines intervenant à Dakar sur des périodes courtes ou longues.

2026-833 - VSC - Chargé d'appui à la recherche scientifique F/H

Wed, 30 Sep 2026 11:37:01 Z

Category : SCIENCE - BAP D : Sciences Humaines et Sociales/D2A41 - Ingénieur-e d’études en production, traitement, analyse de données et enquêtes
Contract type : Temporary
Position description :
Sous la responsabilité d’une anthropologue et ethnoécologue à l’IRD, votre mission sera de venir en soutien à cette dernière et à son équipe engagée dans le projet MaHeWa qui répond à des objectifs de développement durable en Outre-Mer et dans la région Pacifique. Vous pourrez participer aux communautés de savoirs Climat (Changement climatique), Leo (Littoral et Océan) et SyAD (Systèmes alimentaires durables). Vos activités seront les suivantes : Participer aux différents moments des projets, impliquant les chercheurs, les agents de terrain des collectivités, les femmes et les hommes actives dans la pêche et le prélèvement de ressources marines en Nouvelle-Calédonie, ainsi que les élus et les autorités coutumières de l’endroit afin de mieux comprendre les sociétés contemporaines et leurs problématiques en outremer en particulier. Contribuer en appui de l’équipe aux enquêtes de terrain dans un ou des sites d’étude (thèmes principaux : valeur accordée au lagon, mémoire des canicules marines, conditions de circulation des savoirs, cultures du risque). Contribuer au traitement et l’analyse des données collectées. Contribuer à la rédaction des rapports de terrain et des livrables du volet 3 de MaHeWa « Vulnérabilité socio-écologiques ». Participer à la valorisation des résultats scientifiques (colloques et publications scientifiques ; ouverture vers les populations et dialogue science-société). Votre future équipe Vous aurez l’opportunité de rencontrer une grande diversité de chercheurs et de métiers et pourrez ainsi expérimenter le dialogue interdisciplinaire et les interactions avec les institutions et collectivités en demande de résultats de recherche.

Vous avez développé les compétences suivantes : Maîtrise des techniques d’enquêtes des sciences humaines et sociales (questionnaires, entretiens semi-directifs, observation participante). Compétences analytiques, rédactionnelles et de synthèse. Dans le cadre des activités liées à cette mission, des déplacements réguliers sur le terrain sont prévus, le permis de conduire catégorie B est indispensable. Anglais oral et écrit niveau B1-B2. Vous faites preuves des qualités humaines suivantes : Dynamisme et rigueur. Adaptabilité. Capacité à travailler en équipe et en autonomie. Goût pour le travail en équipe pluridisciplinaire et diversifiée socio-culturellement. Une connaissance du contexte insulaire et océanien et/ou une expertise dans le domaine de l’étude des agrosystèmes et/ou de la pêche seront des plus. Vous êtes titulaire d’un diplôme de niveau 7, master ou diplôme d’ingénieur dans les domaines suivants : Anthropologie, Géographie ou impliquant des approches interdisciplinaires. Vos avantages en mission VSC Indemnités mensuelles brutes : 2117.62 € (pour les volontaires dont La Nouvelle Calédonie n'est pas le lieu de résidence principale). Indemnités exonérées de l’impôt sur le revenu. Prise en charge du voyage et transport des bagages (Aller & Retour). Assurance ISOS/HDI.

2026-832 - Post-doctorat – Impact de la recherche sur la transformation des socio-écosystèmes marins H/F

Tue, 29 Sep 2026 14:54:19 Z

Category : SCIENCE - BAP D : Sciences Humaines et Sociales/D1A41 - Ingénieur-e de recherche en production, traitement et analyse de données
Contract type : Temporary
Position description :
Sous la responsabilité conjointe de Adrien Comte, Chargé de recherche à l’IRD (UMR LEMAR), et de Mireille Matt, Directrice de recherche à INRAE (UMR LISIS), et en collaboration avec l’ingénieur de recherche contribuant au WP2, votre mission consistera à contribuer aux activités de recherche sur l’étude des transformations de différents socio-écosystèmes marins de l’océan Indien à l’aide de méthodes d’évaluation d’impact de la recherche basées notamment sur le développement de chemins d’impact (Matt et al. 2023 ; Blundo Canto et al. 2020). Plus spécifiquement, vous serez mobilisé.e dans le co-développement d’une méthodologie d’évaluation d’impacts, incluant la description d’un système d’information approprié pour suivre les chemins vers des transformations sociétales des socio-écosystèmes marins. Une partie de vos activités reviendra à identifier des informations pertinentes pour le suivi-évaluation qui alimenteront ce système d’information, et à définir des descripteurs de suivi et de performance des transformations en cours. Vous viendrez en support à l’animation des ateliers sur les six sites ateliers du PEPR BRIDGES situés sur les territoires français de La Réunion et de Mayotte, aux Comores, au Mozambique, et au niveau régional. Chaque atelier regroupera des chercheurs et acteurs clés pour chacun des socio-écosystèmes. Ensuite, vous assurerez le suivi des activités sur chaque site en lien avec les autres projets du PEPR.

Vous possédez les compétences suivantes : Connaissances interdisciplinaires sur les socio-écosystèmes Maitrise de méthodes d’analyses quantitatives et/ou qualitatives Maitrise de l’anglais professionnel (C2) Expérience d’implication participatif avec différentes parties prenantes Connaissances en gestion de données / de systèmes d’information Familiarité avec la région du sud-ouest de l’océan Indien Familiarité avec les méthodes d’évaluation d’impact de la recherche Vous faites preuve d'autonomie et avez un goût prononcé pour le travail en équipe dans un environnement de recherche international, interdisciplinaire et multiculturel. Vous possédez un diplôme de niveau doctorat dans le domaine de l’économie de l’environnement, la géographie des milieux marins et littoraux, de la gestion de l’environnement, ou équivalent avec idéalement une expérience en recherche dans le domaine des pêches et de la conservation marine. Les postes ouverts au titre du programme postdoctoral de l’IRD sont des contrats de travail à durée déterminée de droit public relevant de l’article L. 412-4 du Code de la recherche.Le contrat postdoctoral doit être conclu au plus tard trois ans après l’obtention du diplôme de doctorat. Peuvent candidater les personnes titulaires du diplôme de doctorat au plus tard à la date de conclusion du contrat postdoctoral. L’IRD, au cours de votre parcours professionnel, vous accompagne dans le développement de vos compétences. L’institut met à votre disposition un panel d’outils tel que le parcours digital d’intégration, l’accès à la formation permanente. L’IRD offre, en fonction des activités, la possibilité de télétravailler de 1 à 3 jours hebdomadaires. En rejoignant l’IRD, vous bénéficierez : De 32 jours de congés + 13 RTT (pour un temps plein). De titre restaurant ou restauration collective. D’une souscription annuelle (facultative) à l’AOS : prestations vacances-loisirs et sportives-culturelles. D’une affiliation à la protection sociale complémentaire MGEN, offrant une couverture santé et prévoyance de qualité.

2026-827 - Assistant Ingénieur Biologiste H/F

Tue, 22 Sep 2026 07:01:55 Z

Category : SCIENCE - BAP A : Sciences du vivant, de la terre et de l’environnement/A3A42 - Assistant-e ingénieur-e en expérimentation et instrumentation biologiques
Contract type : Temporary
Position description :
Sous la responsabilité du responsable du projet ERC TROJAN, vous mettez en œuvre les techniques expérimentales de biologie cellulaire, d’immunologie et de biologie moléculaire nécessaires au projet et vous en assurez le bon déroulement technique et logistique, vos activités seront les suivantes : Culture cellulaire : réaliser et entretenir les cultures cellulaires (parasites, lignées et/ou cultures primaires) en conditions stériles, dans le respect des protocoles établis et des règles d’hygiène et de sécurité. Cytométrie et dosages immunologiques : mettre en œuvre la cytométrie en flux (préparation des échantillons, marquages, acquisition et analyse) et les dosages immuno-enzymatiques (ELISA). Biologie moléculaire : conduire les expériences de biologie moléculaire : extraction d’acides nucléiques, PCR et PCR quantitative, clonage, préparation et contrôle qualité des échantillons. Traçabilité et protocoles : rassembler, mettre en forme et consigner les résultats expérimentaux, tenir le cahier de laboratoire, rédiger et actualiser les protocoles techniques. Analyses et mise en valeur des données : organiser les données collectées et faire l’analyse statistique de résultats expérimentaux. Gestion technique et logistique : assurer la gestion des stocks, des commandes et de l’inventaire, le suivi et la maintenance de premier niveau des équipements, ainsi que la planification de l’utilisation des appareils et des espaces partagés. À titre complémentaire, vous pourrez être amené à : Appui et formation : participer à la formation technique et à l’accompagnement des nouveaux entrants, étudiants et stagiaires, et transmettre les bonnes pratiques de laboratoire. Vie collective : contribuer à la vie de l’équipe et de l’unité et apporter un appui technique ponctuel aux autres membres du projet. Votre future équipe Vous rejoindrez l’équipe TRIAD, qui étudie la biologie cellulaire et la transmission des parasites responsables du paludisme ainsi que leurs interactions avec l’hôte humain. Au sein du projet ERC TROJAN (ERC Advanced Grant, 2024), vous occuperez une position transversale de personne ressource : vous apporterez un appui technique à l’ensemble des membres du projet (chercheurs, post-doctorants, doctorants et stagiaires) et contribuerez au bon fonctionnement quotidien du laboratoire.

Vous avez développé les compétences suivantes : Culture cellulaire : maîtrise des techniques de culture cellulaire en conditions stériles (lignées et/ou cultures primaires). Cytométrie et ELISA : pratique de la cytométrie en flux et des dosages immuno-enzymatiques (ELISA). Biologie moléculaire : maîtrise des techniques courantes de biologie moléculaire (extraction d’acides nucléiques, PCR/qPCR, clonage). Hygiène, sécurité et traçabilité : connaissance et application de la réglementation d’hygiène et de sécurité en laboratoire, tenue rigoureuse d’un cahier de laboratoire et utilisation des logiciels spécifiques à l’activité. Organisation et langue : gestion des stocks, des commandes et de l’inventaire, suivi et maintenance de premier niveau des équipements ; la maîtrise de l’anglais scientifique (niveau A2 à B1) est attendue. Vous faites preuve des qualités humaines suivantes : Sens de l’organisation et rigueur dans la conduite des expériences et la traçabilité des données. Sens relationnel et goût du travail en équipe au sein d’un environnement collaboratif et international. Autonomie et sens des responsabilités avec la capacité à rendre compte de son activité. Curiosité intellectuelle et capacité d’adaptation aux nouvelles techniques et aux évolutions du projet. Vous êtes titulaire d’un diplôme de niveau 5 - 6 BTS/IUT/LICENCE dans le domaine de la biologie ou des sciences et techniques de laboratoire. L’IRD, au cours de votre parcours professionnel, vous accompagne dans le développement de vos compétences. L’institut met à votre disposition un panel d’outils tel que le parcours digital d’intégration, l’accès à la formation permanente, à la promotion et la mobilité. L’IRD offre, en fonction des activités, la possibilité de télétravailler de 1 à 3 jours hebdomadaires. En rejoignant l’IRD, vous bénéficierez : De 32 jours de congés + 13 RTT (pour un temps plein à 38h30 hebdomadaire). Une restauration collective. Souscription annuelle (facultative) à l’Association des Œuvres Sociales : prestations vacances-loisirs et sportives-culturelles. D’une affiliation à la protection sociale complémentaire MGEN, offrant une couverture santé et prévoyance de qualité. D’un cadre de travail agréable, proche de la nature, desservi par le Tram ligne 5 et accessible en vélo et bénéficiant d’un système de co-voiturage (convention mobilité signée avec la métropole). Nos recrutements sont fondés sur les compétences, sans distinction d’origine, d’âge ou de genre et tous nos postes sont ouverts aux personnes en situation de handicap.

2026-820 - A2A43 - Ingénieur-e en techniques biologiques

Fri, 04 Sep 2026 12:42:56 Z

Category : SCIENCE - BAP A : Sciences du vivant, de la terre et de l’environnement/A2A43 - Ingénieur-e en techniques biologiques
Contract type : Temporary
Position description :
La mission consistera à gérer et assister la collecte, l’analyse et la valorisation des données biologiques et environnementales du projet MEDDI « Connaissance et gestion des écosystèmes coralliens mésophotiques du sud-ouest de l’océan Indien ». Sous la responsabilité de M. Mehdi ADJEROUD, Directeur de Recherche à l’IRD au sein de l’UMR ENTROPIE et responsable du projet MEDDI, vos activités seront les suivantes : - Mise en œuvre des protocoles d’échantillonnage, organisation et coordination des activités de terrain - Participation à l’analyse des échantillons - Bancarisation des données biologiques et environnementales - Analyses statistiques des données - Suivi des aspects scientifiques (livrables) du projet. Le projet MEDDI se propose de développer trois actions liées (i) à l’inventaire et à la caractérisation des communautés benthiques et ichtyologiques des écosystèmes coralliens mésophotiques (ECM) de La Réunion et de Madagascar (Toliara, Nosy-Be), (ii) à la dynamique et aux processus démographiques des communautés coralliennes, et (iii) aux mesures de gestion et de conservation de ces ECM. En testant l’hypothèse de zone refuge, ce projet permettra de mieux appréhender l’évolution des écosystèmes côtiers dans un contexte de changement climatique.

Vous avez développé les compétences suivantes : - Connaissances théoriques et pratiques en biologie/écologie marine - Connaissances des équipements de mesure de paramètres environnementaux (sondes) - Connaissance des outils informatiques de traitement de données et de bureautique - Pratique de la plongée scientifique en scaphandre autonome souhaitée - Intérêt pour le travail en équipe Vous faites preuve des qualités humaines suivantes : - Sens de l’organisation - Capacité à travailler en équipe et évaluer les attentes et besoins des publics concernés - Autonomie, rigueur et esprit d’initiative - Importante ouverture d’esprit - Capacité de rédaction et d’analyse Vous êtes titulaire d’un diplôme de niveau Doctorat dans le domaine de la biologie/écologie marine. Le travail pourra comporter des missions embarquées à la journée.

2026-819 - A2A43 - Ingénieur-e en techniques biologiques H/F

Thu, 03 Sep 2026 12:23:11 Z

Category : SCIENCE - BAP A : Sciences du vivant, de la terre et de l’environnement/A2A43 - Ingénieur-e en techniques biologiques
Contract type : Temporary
Position description :
La mission consistera à appuyer la mise en œuvre du projet MEDDI « Connaissance et gestion des écosystèmes coralliens mésophotiques du sud-ouest de l’océan Indien », en assistant la gestion administrative et scientifique du projet. Sous la responsabilité de M. Mehdi ADJEROUD, Directeur de Recherche à l’IRD au sein de l’UMR ENTROPIE et responsable du projet MEDDI, vos activités seront les suivantes : - Aide à la collecte, la mise en valeur, et à la bancarisation des données collectées - Organisation et appui des activités de terrain - Suivi de la réalisation des livrables, et de la communication autour du projet - Coordination entre les partenaires du projet - Suivi des aspects administratifs, budgétaires et réglementaires du projet. Le projet MEDDI se propose de développer trois actions liées (i) à l’inventaire et à la caractérisation des communautés benthiques et ichtyologiques des écosystèmes coralliens mésophotiques (ECM) de La Réunion et de Madagascar (Toliara, Nosy-Be), (ii) à la dynamique et aux processus démographiques des communautés coralliennes, et (iii) aux mesures de gestion et de conservation de ces ECM. En testant l’hypothèse de zone refuge, ce projet permettra de mieux appréhender l’évolution des écosystèmes côtiers dans un contexte de changement climatique.

Vous avez développé les compétences suivantes : - Connaissances théoriques et pratiques en biologie/écologie marine - Connaissances du fonctionnement administratif des instituts et unités de recherche - Connaissance des outils informatiques de traitement de données et de bureautique - Savoir communiquer, transmettre et présenter des résultats - Intérêt pour le travail en équipe Vous faites preuve des qualités humaines suivantes : - Sens de l’organisation, autonomie, rigueur et esprit d’initiative - Capacité à travailler en équipe et évaluer les attentes et besoins des publics concernés - Importante ouverture d’esprit - Capacité d’animation d’équipe - Capacité de rédaction et d’analyse.

2026-811 - Ingénieur.e de recherche en éco-épidémiologie H/F

Thu, 03 Sep 2026 12:05:18 Z

Category : SCIENCE - BAP A : Sciences du vivant, de la terre et de l’environnement/A1A41 - Ingénieur-e biologiste en analyse de données
Contract type : Temporary
Position description :
Vous serez impliqué.e dans un programme de recherche qui vise à comprendre la plasticité écologique des chauves-souris liée à leur adaptation au milieu urbain, et les conséquences sur les dynamiques d’infection. Pour cela, vous rejoindrez une étude en cours sur le Petit Molosse de La Réunion, une minuscule espèce de chauves-souris insectivore, emblématique et à caractère patrimonial, car elle est le seul mammifère indigène et endémique de l’île. Cette espèce s’est adaptée à l’urbanisation croissante de l’île de la Réunion et colonise aujourd’hui de nombreux habitats urbains. Elle est également étudiée depuis plusieurs années car elle naturellement infectée par plusieurs agents infectieux à potentiel zoonotique. Le projet a pour objectif de mesurer comment l’urbanisation peut altérer la physiologie et le comportement des chauves-souris, et en se focalisant sur trois paramètres dans des colonies de Petits Molosses situées dans des habitats plus ou moins urbanisés : les niveaux de stress, la composition du microbiote et celle du régime alimentaire. Pour cela, nous utiliserons des échantillons biologiques qui ont déjà été collectés et sont donc déjà disponibles dans l’unité PIMIT. Nous procéderons également à la collecte de nouveaux échantillons sur le terrain pour compléter l’échantillonnage. Les conséquences sur l’infection seront analysées à travers l’étude de la prévalence et la charge virale/bactérienne de plusieurs agents infectieux tels que les paramyxovirus, les coronavirus et les bactéries leptospires, dont les dynamiques d’infection sont suivies depuis plusieurs années dans l’unité. Ce projet combinera ainsi des questions d’éco-physiologie, d’écologie microbienne et d’épidémiologie en utilisant des approches de sérologie, biologie moléculaire et bioinformatique. Sous la direction de Muriel DIETRICH, Chargée de Recherche IRD dans l’UMR PIMIT, les missions seront de : - mesurer les niveaux de stress (quantité de cortisol) dans les urines de chauves-souris, par une méthode sérologique (kit ELISA commercial). - caractériser le microbiote bactérien et le régime alimentaire à partir des fèces de chauves-souris (préparation des échantillons en laboratoire et analyse bioinformatique), grâce à des techniques de séquençage au débit permettant de mesurer la diversité et la composition des communautés bactériennes et celles d’insectes consommées. - mesurer la charge virale et bactérienne par PCR pour plusieurs agents infectieux. - participer au terrain pour la collecte de nouveaux échantillons. - analyser avec des méthodes biostatistiques les variations spatio-temporelles du stress, du microbiote bactérien, du régime alimentaire et de l’infection, en relation avec le niveau d’urbanisation des colonies de Petits Molosses.

Nous recherchons un.e candidat.e très motivé.e, curieux.se et autonome, titulaire d’un doctorat en écologie, évolution et/ou épidémiologie. Le.la candidat.e devra avoir une expérience en écologie de la faune sauvage avec un profil recouvrant le terrain, le laboratoire et l’analyse de données. Nous recherchons en particulier des compétences sur le terrain (capture de chauves-souris, prélèvements biologiques sur faune sauvage), en laboratoire (sérologie, biologie moléculaire) et en analyses de données (biostatistiques + analyses bioinformatiques de données de séquençage Illumina). D'excellentes compétences en communication, tant à l'oral qu'à l'écrit, sont indispensables, de même que la capacité à interagir et à travailler au sein d'une équipe pluridisciplinaire.

2026-790 - A1A41 - Ingénieur-e biologiste en analyse de données H/F

Mon, 03 Aug 2026 13:09:24 Z

Category : SCIENCE - BAP A : Sciences du vivant, de la terre et de l’environnement/A1A41 - Ingénieur-e biologiste en analyse de données
Contract type : Temporary
Position description :
Vous rejoindrez une équipe de recherche dynamique impliquée dans un projet européen visant à comprendre comment les caractéristiques moléculaires du moustique tigre, son microbiote et les conditions environnementales locales influencent sa capacité à transmettre les quatre sérotypes du virus de la dengue. Vous jouerez un rôle central dans l’analyse, l’intégration des données transcriptomiques et métagénomiques produites dans le cadre des différentes actions du projet TIGRUN. Ces données seront issues de plusieurs tissus du moustique, de différents temps post-infection, des quatre sérotypes du virus de la dengue et de populations naturelles provenant de plusieurs zones microclimatiques de La Réunion. Vos principales missions: -Concevoir, développer, optimiser et documenter des pipelines bioinformatiques reproductibles pour l’analyse de données de séquençage à haut débit Assurer le contrôle qualité, le prétraitement, l’alignement, la quantification et l’analyse statistique des données transcriptomiques issues des différents tissus et conditions expérimentales Conduire les analyses d’expression différentielle et contribuer à l’identification de signatures moléculaires, de voies biologiques et de réseaux de gènes associés à l’infection par les différents sérotypes du virus de la dengue Analyser les données de métagénomique shotgun afin de caractériser la diversité taxonomique et fonctionnelle des microbiotes associés aux populations naturelles d’Aedes albopictus Réaliser des analyses comparatives permettant d’étudier les variations du microbiote entre les localités, les conditions environnementales et les modalités de collecte des moustiques Intégrer les données transcriptomiques et métagénomiques aux métadonnées expérimentales, environnementales et entomologiques, notamment les tissus étudiés, les sérotypes viraux, les temps post-infection, les microclimats et les niveaux de compétence vectorielle Contribuer à l’interprétation biologique des résultats en interaction étroite avec les différents membres et partenaires scientifiques du projet Assurer la structuration, la documentation, la traçabilité et la gestion des données produites, dans le respect des principes de reproductibilité et de science ouverte ; Développer et maintenir un site web interactif destiné à la consultation et à la visualisation des données transcriptomiques et métagénomiques du projet par la communauté scientifique Contribuer à la rédaction d’articles scientifiques, de rapports techniques et de documents de valorisation Présenter les résultats lors de réunions de consortium, de séminaires et de congrès scientifiques nationaux et internationaux Participer au transfert de compétences en bioinformatique et à l’accompagnement des étudiants et personnels impliqués dans le projet. Ce poste vous permettra d’évoluer dans un environnement scientifique multidisciplinaire et international génomique, virologie, entomologie médicale, microbiologie et écologie de la santé.

Le profil que nous recherchons Formation Doctorat en bioinformatique, biologie computationnelle, génomique, biostatistique, biologie des systèmes ou dans une discipline apparentée. Compétences scientifiques et techniques Vous possédez idéalement plusieurs des compétences suivantes : - expérience confirmée dans le traitement et l’analyse de données issues du séquençage à haut débit ; - expertise en analyse de données transcriptomiques, notamment RNA-seq, contrôle qualité, quantification, normalisation et expression différentielle ; - expérience en métagénomique shotgun, en analyse de microbiomes ou dans le traitement de données métagénomiques ; - maîtrise avancée des environnements Linux et des langages de programmation utilisés en bioinformatique, notamment R, Python et Bash ; - solides compétences en statistiques appliquées aux données biologiques multidimensionnelles ; - maîtrise des outils de visualisation et d’interprétation des données génomiques et multi-omiques ; - connaissance des bases de données biologiques, des méthodes d’annotation fonctionnelle et des standards associés aux données omiques ; - expérience dans la conception de pipelines automatisés, documentés et reproductibles ; - capacité à structurer, documenter et gérer des jeux de données complexes et leurs métadonnées ; - connaissances en développement d’interfaces web, de bases de données ou d’applications interactives de visualisation appréciées ; - connaissances en virologie, microbiologie, entomologie médicale ou biologie des vecteurs appréciées. Qualités personnelles Vous êtes reconnu(e) pour : - votre rigueur scientifique et votre capacité d’analyse ; - votre autonomie, votre esprit d’initiative et votre sens de l’organisation ; - votre aptitude à conduire plusieurs analyses complexes dans le respect des échéances du projet ; - votre capacité à travailler à l’interface entre bioinformatique et biologie expérimentale ; - vos qualités rédactionnelles et votre aptitude à communiquer les résultats scientifiques à l’écrit comme à l’oral. Une bonne maîtrise de l’anglais scientifique est également attendue.