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2026-837 - Chercheur en biogéochimie des hydrosystèmes tropicaux H/F

Mon, 05 Oct 2026 12:52:19 Z

Domaine / métier : SCIENCE - Chercheurs-es/Post Doctorant-es
Poste ouvert aux : : Contractuels
Description du poste :
Le projet : Les cours d’eau et les zones humides jouent un rôle majeur dans les cycles du carbone et de l’azote et contribuent de manière importante aux émissions de GES vers l’atmosphère. Pourtant, les systèmes aquatiques tropicaux restent encore peu étudiés à l’échelle globale, notamment en raison du manque de données permettant de caractériser leur variabilité temporelle et l’influence des activités humaines. Le projet GHG-STREAMS vise à mieux comprendre la dynamique des GES dans les hydrosystèmes tropicaux et l’influence des activités humaines sur ces émissions. Il s’appuiera sur la mise en place d’un nouvel observatoire des GES aquatiques au Kenya, combinant un suivi à haute fréquence, des campagnes de terrain à l’échelle régionale et des approches de modélisation spatiale. Les recherches porteront sur des petits cours d’eau et des zones humides répartis le long d’un gradient d’occupation des sols, depuis des écosystèmes relativement préservés jusqu’à des bassins versants agricoles et urbains. Le projet abordera trois questions clés : · Comment l’occupation des sols et les événements hydrologiques régulent-ils la dynamique des GES dans les hydrosystèmes tropicaux ? · Comment distinguer les sources naturelles et anthropiques d’émissions de GES ? · Comment passer de mesures à l’échelle locale à des estimations régionales pertinentes pour l’établissement de bilans carbone ? Sous la responsabilité de Clément Duvert (IRD/CEREGE) et en interaction avec des spécialistes de l’hydrologie, de la géochimie et des changements environnementaux, notamment Thomas Stieglitz (IRD/CEREGE), vous serez chargé de développer le volet kényan du projet, en étroite collaboration avec le responsable scientifique et les partenaires locaux. Elle aura notamment pour missions de : - Déployer un réseau de suivi à haute fréquence incluant des capteurs mesurant le CO2 dissous, l’oxygène, la conductivité et différentes variables hydrologiques ; - Coordonner les campagnes de terrain au Kenya ; - Développer des approches permettant de quantifier les émissions de GES, d’identifier leurs facteurs de contrôle et d’extrapoler les observations vers des échelles spatiales plus larges ; - Piloter l’analyse des données et la publication des résultats ; - Contribuer à l’encadrement et à l’accompagnement d’étudiant·es de doctorat et de master impliqué·es dans le projet. Le poste offre une large autonomie scientifique, avec la possibilité de développer ses propres questions de recherche dans le cadre du projet.

Nous recherchons un·e chercheur·se ayant un intérêt pour les hydrosystèmes tropicaux et les changements environnementaux globaux. Compétences requises - Doctorat (obtenu il y a moins de 3 ans au moment de la prise de fonction, ou en cours de finalisation) en sciences de l’environnement, hydrologie, hydrogéologie, (bio)géochimie ou similaire ; - Expérience dans l’acquisition de données sur le terrain ; - Compétences quantitatives et maîtrise de R, Python ou MATLAB ; - Expérience de la publication de résultats dans des revues internationales ; - Intérêt pour la recherche dans les pays du Sud et pour la participation à des campagnes de terrain de longue durée. Compétences complémentaires appréciées - Expérience de terrain en milieu tropical ; - Expérience dans la mesure des GES dans des hydrosystèmes ; - Expérience en utilisation de traceurs isotopiques et/ou interactions nappe–rivière ; - Expérience en modélisation spatiale et télédétection ; - Maîtrise du français ou volonté de l’apprendre.

2026-736 - VSC – ingénieur informatique - géomatique F/H

Wed, 30 Sep 2026 11:52:25 Z

Domaine / métier : APPUI - Informatique/E2B44 - Administrateur-trice de bases de données / Intégrateur d'applications
Poste ouvert aux : : Contractuels
Description du poste :
Sous la responsabilité d’un ingénieur IRD, votre mission principale sera d’exploiter le dispositif ainsi que les chaines de traitements qui y seront implantées. Vos activités seront les suivantes : Manipulation / opération d'outils de gestion ou de production de la plateforme SEAS-GUYANE. Appui à l’intégration et à la mise au format de données numériques pour la diffusion via le portail SEAS-GUYANE. Appui à l'animation et au soutien des communautés utilisatrices de SEAS-GUYANE notamment pour les questions géomatiques. Administrer une partie du dispositif SEAS-GUYANE de production des images à partir des données reçues. Participer au déploiement de chaines de traitement et analyse de données : pré-traitements d'imagerie satellitaire, extraction d'information utile, traitements de données spatialisées, automatisation de traitements routiniers, formalisation d'indicateurs bio-géo-physiques de caractérisation ou de suivi de processus et dynamiques environnementaux. Participer à une veille technologique afin de proposer des solutions techniques adaptées aux besoins des équipes. Votre future équipe Vous intégrerez l’équipe technique composée de 2 ingénieurs et vous participerez aux activités et projets de recherche menées au sein de l’UMR ESPACE–DEV en Guyane qui totalise 10 enseignants chercheurs.

Vous avez développé les compétences suivantes : Administration système des environnements Linux. Bonne maitrise d'un ou de plusieurs outils standards de manipulation et de traitement d'informations géographiques et d'imagerie satellitaire, de traitement statistique de données (QGIS, OTB, R). Connaissance de langages de programmation informatique et des capacités de développement (Python, Bash). Bonne capacité rédactionnelle afin de valoriser et de diffuser les activités et résultats de recherche. Vous faites preuve des qualités humaines suivantes : Capacité à travailler en équipe et à être force de proposition. Rigueur, organisation, capacités rédactionnelles (reporting, cahier des charges, spécifications techniques). Autonomie, qualités relationnelles, ouverture d'esprit. Qualité de communication et bon relationnel Vous possédez un diplôme de niveau 6-7 (Licence, Master 2 ou diplôme d’ingénieur) en traitement d’images et programmation, informatique géomatique et télédétection / traitement de données.

2026-833 - VSC - Chargé d'appui à la recherche scientifique F/H

Wed, 30 Sep 2026 11:37:01 Z

Domaine / métier : SCIENCE - BAP D : Sciences Humaines et Sociales/D2A41 - Ingénieur-e d’études en production, traitement, analyse de données et enquêtes
Poste ouvert aux : : Contractuels
Description du poste :
Sous la responsabilité d’une anthropologue et ethnoécologue à l’IRD, votre mission sera de venir en soutien à cette dernière et à son équipe engagée dans le projet MaHeWa qui répond à des objectifs de développement durable en Outre-Mer et dans la région Pacifique. Vous pourrez participer aux communautés de savoirs Climat (Changement climatique), Leo (Littoral et Océan) et SyAD (Systèmes alimentaires durables). Vos activités seront les suivantes : Participer aux différents moments des projets, impliquant les chercheurs, les agents de terrain des collectivités, les femmes et les hommes actives dans la pêche et le prélèvement de ressources marines en Nouvelle-Calédonie, ainsi que les élus et les autorités coutumières de l’endroit afin de mieux comprendre les sociétés contemporaines et leurs problématiques en outremer en particulier. Contribuer en appui de l’équipe aux enquêtes de terrain dans un ou des sites d’étude (thèmes principaux : valeur accordée au lagon, mémoire des canicules marines, conditions de circulation des savoirs, cultures du risque). Contribuer au traitement et l’analyse des données collectées. Contribuer à la rédaction des rapports de terrain et des livrables du volet 3 de MaHeWa « Vulnérabilité socio-écologiques ». Participer à la valorisation des résultats scientifiques (colloques et publications scientifiques ; ouverture vers les populations et dialogue science-société). Votre future équipe Vous aurez l’opportunité de rencontrer une grande diversité de chercheurs et de métiers et pourrez ainsi expérimenter le dialogue interdisciplinaire et les interactions avec les institutions et collectivités en demande de résultats de recherche.

Vous avez développé les compétences suivantes : Maîtrise des techniques d’enquêtes des sciences humaines et sociales (questionnaires, entretiens semi-directifs, observation participante). Compétences analytiques, rédactionnelles et de synthèse. Dans le cadre des activités liées à cette mission, des déplacements réguliers sur le terrain sont prévus, le permis de conduire catégorie B est indispensable. Anglais oral et écrit niveau B1-B2. Vous faites preuves des qualités humaines suivantes : Dynamisme et rigueur. Adaptabilité. Capacité à travailler en équipe et en autonomie. Goût pour le travail en équipe pluridisciplinaire et diversifiée socio-culturellement. Une connaissance du contexte insulaire et océanien et/ou une expertise dans le domaine de l’étude des agrosystèmes et/ou de la pêche seront des plus. Vous êtes titulaire d’un diplôme de niveau 7, master ou diplôme d’ingénieur dans les domaines suivants : Anthropologie, Géographie ou impliquant des approches interdisciplinaires. Vos avantages en mission VSC Indemnités mensuelles brutes : 2117.62 € (pour les volontaires dont La Nouvelle Calédonie n'est pas le lieu de résidence principale). Indemnités exonérées de l’impôt sur le revenu. Prise en charge du voyage et transport des bagages (Aller & Retour). Assurance ISOS/HDI.

2026-757 - STAGE - Assitant(e) de projets H/F

Thu, 24 Sep 2026 11:36:59 Z

Domaine / métier : APPUI - Partenariat, valorisation et coopération/J2B44 - Chargé-e d'appui au projet de recherche
Poste ouvert aux : : Contractuels
Description du poste :
Sous la responsabilité d’une cheffe de stage, vous appuierez l’organisation et la mise en œuvre des Trophées de l’innovation : L’IRD organise la 4ème édition des Trophées de l’innovation, un concours visant à récompenser les projets de doctorants et jeunes chercheurs de solutions innovantes et durables en lien avec la recherche de l’IRD. En 2026, le concours porte sur : « Changer le quotidien, bâtir l'avenir - une recherche engagée pour les femmes et les filles ». Il récompensera deux solutions innovantes contribuant à l’amélioration de la vie des femmes et des filles, à l’échelle locale ou mondiale et quel que soit le domaine de recherche : santé, éducation, systèmes alimentaires, sphères économique et politique, culture et société... Dès à présent, nous travaillons en parallèle sur l’élaboration de la prochaine édition, celle de l’année 2027. Le concours étant international, certaines phases d’accompagnement seront dispensées en anglais ; il est donc important d’être à l’aise dans cette langue. Toute langue supplémentaire sera appréciée. Vos missions de coordination et d’appui opérationnel : • Appui à la coordination générale et la mise en oeuvre des Trophées (gestion de projet). • Participation à la gestion administrative et logistique du programme : contact avec les partenaires, mobilisation de l’équipe communication, échanges avec les représentations basées à l’international… • Contribution aux différentes phases du concours : sélection des candidatures, conception des parcours d’accompagnement et des formations, préparation de l’événement international de pitch et de la cérémonie de remise des Trophées. • Appui au suivi des lauréat.e.s des éditions précédentes, en lien avec l’incubateur local. • Participation aux activités générales de la Direction (réunions, séminaires, …) « À l’issue de ce stage, vous aurez développé des compétences solides en gestion de projet. Vous aurez également acquis une bonne compréhension de l’innovation en recherche, de ses enjeux et des mécanismes de valorisation et vous serez doté de bonnes connaissances en événementiel. »

Niveau de diplôme préparé : master 2 ou année de césure en gestion de projet, innovation, relations internationales, coopération internationale, ou autres domaines similaires. Compétences attendues : ▪ Maîtrise des outils bureautiques (PackOffice, Google Workspace,Teams…) et de communication (Canva) ▪ Excellentes capacités d’expression, orale et écrite en français et en anglais ▪ Connaissance d’outils de gestion de projet appréciée ▪ Communication interculturelle. Qualités du profil : ▪ Sens de l’organisation ▪ Aptitude au travail en équipe ▪ Esprit d’initiative ▪ Sens de l’écoute ▪ Autonomie

2026-825 - J2C46 - Chargé-e de gestion administrative et d'aide au pilotage opérationnel H/F

Mon, 21 Sep 2026 09:46:54 Z

Domaine / métier : APPUI - Administration et pilotage/J2C46 - Chargé-e de gestion administrative et d'aide au pilotage opérationnel
Poste ouvert aux : : Contractuels
Description du poste :
L’ingénieur·e d’études assurera la coordination administrative, financière, logistique et opérationnelle des projets DENPHYTOVIR/TIGRUN, en lien étroit avec le coordinateur du projet, la représentation de l’IRD à La Réunion, l’UMR PIMIT et l’ensemble des partenaires du consortium. Il/elle veillera au bon déroulement administratif du projet et au respect du calendrier, des échéances, des livrables et des règles applicables au financement FEDER/INTERREG. Il/elle mettra en place et actualisera les outils de suivi nécessaires au pilotage du projet : tableaux de bord, échéanciers, suivi budgétaire, suivi des dépenses et des pièces justificatives, indicateurs et documents de reporting.Il/elle contribuera également au suivi des obligations réglementaires liées à l’accès et à l’utilisation des ressources biologiques et génétiques, notamment dans le cadre du Protocole de Nagoya et des dispositifs d’accès et de partage des avantages (APA/ABS). En lien avec les partenaires et les services compétents, il/elle participera à la centralisation et à la traçabilité des documents nécessaires : autorisations, permis, consentements, conditions convenues d’un commun accord, accords de transfert de matériel (MTA) et autres pièces de conformité applicables.

Activités principales · assurer, avec la représentation de l’IRD à La Réunion, la gestion administrative et financière courante des projets ; · suivre les commandes de réactifs et consommables, les engagements, factures, justificatifs et leur archivage ; · assurer le suivi des fiches de temps des personnels impliqués dans le projet ; · tenir à jour les tableaux de bord, le calendrier, les jalons, les livrables et les indicateurs ; · préparer les éléments nécessaires aux rapports administratifs et financiers et contribuer à leur rédaction ; · organiser les réunions de travail, comités de suivi, visioconférences et déplacements liés au projet, et assurer le suivi des décisions ; · assurer la gestion administrative des missions, ainsi que l’accueil des stagiaires, chercheurs et visiteurs ; · faciliter la circulation de l’information entre les équipes scientifiques, la représentation de l’IRD et les partenaires internationaux ; · contribuer au suivi documentaire des obligations liées au Protocole de Nagoya, à l’APA/ABS et aux transferts de ressources ou d’échantillons ; · identifier les risques de retard ou de non-conformité administrative et en informer le coordinateur du projet. Livrables attendus · tableaux de bord administratif et financier actualisés ; · commandes, factures et pièces justificatives validées et archivées ; · fiches de suivi du temps des personnels validées et archivées ; · suivi des missions, réunions, stagiaires et visiteurs ; · dossier documentaire de conformité Nagoya/APA et transferts de matériel tenu à jour ; · contributions aux rapports administratifs et financiers du projet. Responsable fonctionnel du poste : Pr Chaker EL KALAMOUNI, coordinateur du projet DENPHYTOVIR.

2026-821 - Post Doctorant-es H/F

Thu, 03 Sep 2026 12:23:40 Z

Domaine / métier : SCIENCE - Chercheurs-es/Post Doctorant-es
Poste ouvert aux : : Contractuels
Description du poste :
La mission consistera à gérer la collecte, l’analyse et la valorisation des données biologiques et environnementales du projet MEDDI « Connaissance et gestion des écosystèmes coralliens mésophotiques du sud-ouest de l’océan Indien ». Sous la responsabilité de M. Mehdi ADJEROUD, Directeur de Recherche à l’IRD au sein de l’UMR ENTROPIE et responsable du projet MEDDI, vos activités seront les suivantes : - Développer et mettre en œuvre une stratégie d’échantillonnage - Organiser et superviser les activités de terrain, d’analyse et de valorisation des résultats - Assurer la collecte, la mise en valeur, et la bancarisation des données collectées - Assurer la coordination scientifique entre les partenaires du projet - Superviser la réalisation des livrables et la valorisation des données. Le projet MEDDI se propose de développer trois actions liées (i) à l’inventaire et à la caractérisation des communautés benthiques et ichtyologiques des écosystèmes coralliens mésophotiques (ECM) de La Réunion et de Madagascar (Toliara, Nosy-Be), (ii) à la dynamique et aux processus démographiques des communautés coralliennes, et (iii) aux mesures de gestion et de conservation de ces ECM. En testant l’hypothèse de zone refuge, ce projet permettra de mieux appréhender l’évolution des écosystèmes côtiers dans un contexte de changement climatique.

Vous avez développé les compétences suivantes : - Connaissances théoriques et pratiques en biologie/écologie marine - Connaissance des outils informatiques de traitement de données statistiques et de bureautique - Savoir communiquer, transmettre et présenter des résultats, et intérêt pour le travail en équipe - Pratique de la plongée scientifique en scaphandre autonome - Capacité à rédiger des articles scientifiques dans des journaux de rang A Vous faites preuve des qualités humaines suivantes : - Sens de l’organisation - Capacité à travailler en équipe et évaluer les attentes et besoins des publics concernés - Autonomie, rigueur et esprit d’initiative - Importante ouverture d’esprit - Capacité de rédaction et d’analyse Vous êtes titulaire d’un diplôme de niveau Doctorat dans le domaine de la biologie/écologie marine.

2026-811 - Ingénieur.e de recherche en éco-épidémiologie H/F

Thu, 03 Sep 2026 12:05:18 Z

Domaine / métier : SCIENCE - BAP A : Sciences du vivant, de la terre et de l’environnement/A1A41 - Ingénieur-e biologiste en analyse de données
Poste ouvert aux : : Contractuels
Description du poste :
Vous serez impliqué.e dans un programme de recherche qui vise à comprendre la plasticité écologique des chauves-souris liée à leur adaptation au milieu urbain, et les conséquences sur les dynamiques d’infection. Pour cela, vous rejoindrez une étude en cours sur le Petit Molosse de La Réunion, une minuscule espèce de chauves-souris insectivore, emblématique et à caractère patrimonial, car elle est le seul mammifère indigène et endémique de l’île. Cette espèce s’est adaptée à l’urbanisation croissante de l’île de la Réunion et colonise aujourd’hui de nombreux habitats urbains. Elle est également étudiée depuis plusieurs années car elle naturellement infectée par plusieurs agents infectieux à potentiel zoonotique. Le projet a pour objectif de mesurer comment l’urbanisation peut altérer la physiologie et le comportement des chauves-souris, et en se focalisant sur trois paramètres dans des colonies de Petits Molosses situées dans des habitats plus ou moins urbanisés : les niveaux de stress, la composition du microbiote et celle du régime alimentaire. Pour cela, nous utiliserons des échantillons biologiques qui ont déjà été collectés et sont donc déjà disponibles dans l’unité PIMIT. Nous procéderons également à la collecte de nouveaux échantillons sur le terrain pour compléter l’échantillonnage. Les conséquences sur l’infection seront analysées à travers l’étude de la prévalence et la charge virale/bactérienne de plusieurs agents infectieux tels que les paramyxovirus, les coronavirus et les bactéries leptospires, dont les dynamiques d’infection sont suivies depuis plusieurs années dans l’unité. Ce projet combinera ainsi des questions d’éco-physiologie, d’écologie microbienne et d’épidémiologie en utilisant des approches de sérologie, biologie moléculaire et bioinformatique. Sous la direction de Muriel DIETRICH, Chargée de Recherche IRD dans l’UMR PIMIT, les missions seront de : - mesurer les niveaux de stress (quantité de cortisol) dans les urines de chauves-souris, par une méthode sérologique (kit ELISA commercial). - caractériser le microbiote bactérien et le régime alimentaire à partir des fèces de chauves-souris (préparation des échantillons en laboratoire et analyse bioinformatique), grâce à des techniques de séquençage au débit permettant de mesurer la diversité et la composition des communautés bactériennes et celles d’insectes consommées. - mesurer la charge virale et bactérienne par PCR pour plusieurs agents infectieux. - participer au terrain pour la collecte de nouveaux échantillons. - analyser avec des méthodes biostatistiques les variations spatio-temporelles du stress, du microbiote bactérien, du régime alimentaire et de l’infection, en relation avec le niveau d’urbanisation des colonies de Petits Molosses.

Nous recherchons un.e candidat.e très motivé.e, curieux.se et autonome, titulaire d’un doctorat en écologie, évolution et/ou épidémiologie. Le.la candidat.e devra avoir une expérience en écologie de la faune sauvage avec un profil recouvrant le terrain, le laboratoire et l’analyse de données. Nous recherchons en particulier des compétences sur le terrain (capture de chauves-souris, prélèvements biologiques sur faune sauvage), en laboratoire (sérologie, biologie moléculaire) et en analyses de données (biostatistiques + analyses bioinformatiques de données de séquençage Illumina). D'excellentes compétences en communication, tant à l'oral qu'à l'écrit, sont indispensables, de même que la capacité à interagir et à travailler au sein d'une équipe pluridisciplinaire.

2026-813 - Chercheur projet gouvernement des migrations au-delà des frontières H/F

Tue, 25 Aug 2026 14:56:10 Z

Domaine / métier : SCIENCE - Chercheurs-es/Post Doctorant-es
Poste ouvert aux : : Contractuels
Description du poste :
Sous la responsabilité de Federica Infantino, vos activités seront les suivantes : Vous contribuez aux activités de recherche liées au projet « Le gouvernement des migrations au-delà des frontières. Diplomatie, coopération et externalisation. » Ce projet propose d’étudier la diplomatie migratoire, la coopération internationale et l’externalisation dans les domaines du contrôle des frontières et des politiques d’expulsion dans une perspective d’analyse originale qui consiste à considérer ces domaines comme des champs de pratiques et à questionner la manière dont les configurations d’acteurs impliqués et leurs interactions sociales façonnent le gouvernement des migrations dans des contextes asymétriques de pouvoir. Dans le cadre de ce projet, votre mission se concentre sur le cas du Maroc que vous développez en partenariat avec les universités marocaines. Vos 5 activités principales : 1.Mener des recherches et des analyses documentaires sur plusieurs volets : Les évolutions majeures de la politique migratoire marocaine et de la diplomatie migratoire du Maroc vis-à-vis de l’Union Africaine et d’autres États en Afrique notamment dans la région du Sahel ; La coopération formelle et informelle Les processus régionaux consultatifs (Processus de Rabat, EUROMED etc.), initiatives liées à la mise en œuvre des objectifs du Pacte Global sur les Migrations des Nations Unies, le Pacte européen sur l’asile et les migrations, la stratégie de gestion intégrée des frontières de l’UE (EUIBM), la coopération policière (Frontex, I-ONE, CCPAO). 2.Mener des enquêtes de terrain (entretiens, observations participantes) auprès des acteurs et des organisations impliqués dans les processus et arènes identifiées afin de produire des données originales. 3.Diffuser les analyses et les résultats des enquêtes par des publications et des communications scientifiques aux niveaux local/national et international, en anglais et en français. 4.Participer et contribuer à la vie scientifique des laboratoires impliqués par l’animation de journées d’étude, la participation active aux séminaires, le soutien et la participation aux activités du réseau international GovMig. 5.Participer et contribuer aux activités pédagogiques des laboratoires impliqués par l’animation de séances portant sur les sujets spécifiques du projet. Vous mènerez deux activités secondaires visant à renforcer l’impact sociétal du projet : - Identification d'interlocuteurs parmi les participants aux enquêtes et les acteurs de la société civile, à qui proposer des restitutions sur les résultats des enquêtes et des moments clefs pour proposer ces restitutions.

Vous avez développé les compétences suivantes : · Connaissance des enjeux épistémologiques et méthodologiques de la recherche en particulier en sciences humaines et sociales sur le champ des études sur la migration et son gouvernement · Élaborer et mettre en œuvre une méthodologie d’enquête · Très bonne maîtrise de la langue française et de la langue anglaise écrite et oral · Rédaction, synthèse écrite et orale · Très bonne maîtrise de l’arabe à l’oral et de l’arabe dialectal marocain (darija) - compétence souhaitable Vous faites preuve des qualités humaines suivantes : · Sens de l’organisation, rigueur et méthode, respect des délais · Capacité d’écoute · Sens des responsabilités et de l’initiative · Capacité à dialoguer/communiquer avec et vers des publics divers · Autonomie

2026-790 - A1A41 - Ingénieur-e biologiste en analyse de données H/F

Mon, 03 Aug 2026 13:09:24 Z

Domaine / métier : SCIENCE - BAP A : Sciences du vivant, de la terre et de l’environnement/A1A41 - Ingénieur-e biologiste en analyse de données
Poste ouvert aux : : Contractuels
Description du poste :
Vous rejoindrez une équipe de recherche dynamique impliquée dans un projet européen visant à comprendre comment les caractéristiques moléculaires du moustique tigre, son microbiote et les conditions environnementales locales influencent sa capacité à transmettre les quatre sérotypes du virus de la dengue. Vous jouerez un rôle central dans l’analyse, l’intégration des données transcriptomiques et métagénomiques produites dans le cadre des différentes actions du projet TIGRUN. Ces données seront issues de plusieurs tissus du moustique, de différents temps post-infection, des quatre sérotypes du virus de la dengue et de populations naturelles provenant de plusieurs zones microclimatiques de La Réunion. Vos principales missions: -Concevoir, développer, optimiser et documenter des pipelines bioinformatiques reproductibles pour l’analyse de données de séquençage à haut débit Assurer le contrôle qualité, le prétraitement, l’alignement, la quantification et l’analyse statistique des données transcriptomiques issues des différents tissus et conditions expérimentales Conduire les analyses d’expression différentielle et contribuer à l’identification de signatures moléculaires, de voies biologiques et de réseaux de gènes associés à l’infection par les différents sérotypes du virus de la dengue Analyser les données de métagénomique shotgun afin de caractériser la diversité taxonomique et fonctionnelle des microbiotes associés aux populations naturelles d’Aedes albopictus Réaliser des analyses comparatives permettant d’étudier les variations du microbiote entre les localités, les conditions environnementales et les modalités de collecte des moustiques Intégrer les données transcriptomiques et métagénomiques aux métadonnées expérimentales, environnementales et entomologiques, notamment les tissus étudiés, les sérotypes viraux, les temps post-infection, les microclimats et les niveaux de compétence vectorielle Contribuer à l’interprétation biologique des résultats en interaction étroite avec les différents membres et partenaires scientifiques du projet Assurer la structuration, la documentation, la traçabilité et la gestion des données produites, dans le respect des principes de reproductibilité et de science ouverte ; Développer et maintenir un site web interactif destiné à la consultation et à la visualisation des données transcriptomiques et métagénomiques du projet par la communauté scientifique Contribuer à la rédaction d’articles scientifiques, de rapports techniques et de documents de valorisation Présenter les résultats lors de réunions de consortium, de séminaires et de congrès scientifiques nationaux et internationaux Participer au transfert de compétences en bioinformatique et à l’accompagnement des étudiants et personnels impliqués dans le projet. Ce poste vous permettra d’évoluer dans un environnement scientifique multidisciplinaire et international génomique, virologie, entomologie médicale, microbiologie et écologie de la santé.

Le profil que nous recherchons Formation Doctorat en bioinformatique, biologie computationnelle, génomique, biostatistique, biologie des systèmes ou dans une discipline apparentée. Compétences scientifiques et techniques Vous possédez idéalement plusieurs des compétences suivantes : - expérience confirmée dans le traitement et l’analyse de données issues du séquençage à haut débit ; - expertise en analyse de données transcriptomiques, notamment RNA-seq, contrôle qualité, quantification, normalisation et expression différentielle ; - expérience en métagénomique shotgun, en analyse de microbiomes ou dans le traitement de données métagénomiques ; - maîtrise avancée des environnements Linux et des langages de programmation utilisés en bioinformatique, notamment R, Python et Bash ; - solides compétences en statistiques appliquées aux données biologiques multidimensionnelles ; - maîtrise des outils de visualisation et d’interprétation des données génomiques et multi-omiques ; - connaissance des bases de données biologiques, des méthodes d’annotation fonctionnelle et des standards associés aux données omiques ; - expérience dans la conception de pipelines automatisés, documentés et reproductibles ; - capacité à structurer, documenter et gérer des jeux de données complexes et leurs métadonnées ; - connaissances en développement d’interfaces web, de bases de données ou d’applications interactives de visualisation appréciées ; - connaissances en virologie, microbiologie, entomologie médicale ou biologie des vecteurs appréciées. Qualités personnelles Vous êtes reconnu(e) pour : - votre rigueur scientifique et votre capacité d’analyse ; - votre autonomie, votre esprit d’initiative et votre sens de l’organisation ; - votre aptitude à conduire plusieurs analyses complexes dans le respect des échéances du projet ; - votre capacité à travailler à l’interface entre bioinformatique et biologie expérimentale ; - vos qualités rédactionnelles et votre aptitude à communiquer les résultats scientifiques à l’écrit comme à l’oral. Une bonne maîtrise de l’anglais scientifique est également attendue.