Export RSS des offres - Seulement les offres à la une : Non / Profil : SCIENCE - BAP A : Sciences du vivant, de la terre et de l’environnement-->A2A43 - Ingénieur-e en techniques biologiques, SCIENCE - BAP B : Sciences chimiques et Sciences des matériaux-->B1A41 - Ingénieur-e de recherche en analyse chimique, SCIENCE - BAP E : Informatique (scientifique), Statistiques et Calcul scientifique-->E1E45 - Expert-e en calcul scientifique, APPUI - Informatique-->E2B44 - Administrateur-trice de bases de données / Intégrateur d'applications, SCIENCE - BAP E : Informatique (scientifique), Statistiques et Calcul scientifique-->E2D46 - Ingénieur-e statisticien-ne, APPUI - Informatique-->E4X41 - Technicien-ne d'exploitation, d'assistance et de traitement de l'information, APPUI - Partenariat, valorisation et coopération-->J2B44 - Chargé-e d'appui au projet de recherche / Poste ouvert aux : : Contractuels

2026-810 - Ingénieur en Analyses Métabolomiques & Chimie des Substances Naturelles Marines H/F

Thu, 20 Aug 2026 13:45:06 Z

Domaine / métier : SCIENCE - BAP B : Sciences chimiques et Sciences des matériaux/B1A41 - Ingénieur-e de recherche en analyse chimique
Poste ouvert aux : : Contractuels
Description du poste :
Le projet Marine Microswimmers (2026-2028), financé par la fondation BNP Paribas, a pour objectif d’etudier les phénomènes de chemo-attraction entre microorganismes marins et les espèces benthiques (coraux, gorgones, éponges, herbiers) afin de développer des stratégies innovantes de restauration écologique face au changement climatique et à l’érosion de la biodiversité. La Mission de l’agent sera de mener à bien les analyses métabolomiques par spectrométrie de masse de l’ensemble des extraits standardisés d’invertébrés marins (Porifères, Cnidaires) et de Posidonies, d’assurer une annotation spectrale la plus exhaustive possible, et d’établir des analyses biochimiométriques en lien avec les résultats de chemo-attractions in situ. Au sein de la station marine d’Endoume, l’agent sera sous la responsabilité de Stéphane Greff (IE, AMU) en charge technique du service MSN à Endoume, et de Charlotte Simmler (CR-CNRS) responsable scientifique du service. Vos activités seront les suivantes : - Assurer de façon autonome les analyses métabolomiques de l’acquisition au traitement de données et à l’annotation des spectres MS2. - Organiser les échantillons pour le maintien d’une banque d’extraits marins au sein du service. - Préparer à la demande de nouveaux extraits selon les besoins en analyses biologiques. - Promouvoir la communication au sein du projet pour intégrer les résultats biologiques de chemo-attractions – participation active aux réunions du groupe de recherche. - Rédiger des articles scientifiques.

Vous avez développé les compétences suivantes : - Analyses métabolomiques par Spectrométrie de Masse, et traitement de données, compétences en analyses multivariées, et outils d’annotations chemoinformatiques multiples. - Compétences en purification et élucidation de structures par RMN/ MS et autres techniques spectroscopiques - Connaissances en écologie chimique marine. Vous faites preuve des qualités humaines suivantes : - Travail en équipe avec communication en Anglais - Sens de l’organisation, capacité rédactionnelle - Autonomie et prise d’initiative

2026-809 - Ingénieur en bioinformatique, traitement de données biologiques et environnementales H/F

Thu, 20 Aug 2026 13:43:49 Z

Domaine / métier : SCIENCE - BAP E : Informatique (scientifique), Statistiques et Calcul scientifique/E1E45 - Expert-e en calcul scientifique
Poste ouvert aux : : Contractuels
Description du poste :
Le projet Marine Microswimmers (2026–2028), financé par la Fondation BNP Paribas, vise à étudier les phénomènes de chimio-attraction entre les microorganismes marins et les organismes benthiques (coraux, gorgones, éponges, herbiers) afin de développer des stratégies innovantes de restauration écologique face au changement climatique et à l'érosion de la biodiversité. Votre mission consistera à conduire les analyses bioinformatiques du projet et à intégrer les résultats avec des jeux de données métabolomiques, microscopiques et environnementales. Sous la responsabilité de Nicolas Garcia Seyda (post-doctorant, IRD) et de Magali Lescot (IRHC, CNRS), les principales activités seront les suivantes : 1. Concevoir et développer des méthodes et des pipelines bioinformatiques pour l'intégration et l'analyse de données multi-omiques, d'imagerie et de paramètres environnementaux. 2. Structurer, harmoniser et assurer l'interopérabilité de grands jeux de données, conformément aux principes FAIR et aux standards internationaux. 3. Valoriser les développements méthodologiques et les résultats scientifiques par la rédaction de publications, la diffusion des outils développés (logiciels, pipelines, documentation) et la participation à des projets collaboratifs nationaux et internationaux. 4. Assurer une veille scientifique et technologique. 5. Participer à l'animation scientifique du projet ainsi qu'à la communication auprès du grand public.

Titulaire d'un diplôme de niveau Bac +5 (Master ou diplôme d'ingénieur) en bioinformatique, sciences des données, écologie numérique, génomique environnementale ou discipline connexe, le ou la candidate devra posséder une solide expertise dans le développement de méthodes d'analyse et de traitement de données biologiques et environnementales à grande échelle. Vous maîtrisez les approches de bioinformatique appliquées aux données multi-omiques (métabarcoding 16S/18S, métagénomique, métatranscriptomique), l'intégration de données multimodales et hétérogènes (imagerie, données omiques, paramètres physico-chimiques) ainsi que les méthodes statistiques multivariées, de réduction de dimension et d'apprentissage automatique (machine learning, deep learning et intelligence artificielle). Vous possédez de solides compétences en programmation scientifique (Python, R, C/C++, MATLAB, Java, JavaScript, PHP), en scripting Linux (Bash), ainsi qu'en développement de pipelines reproductibles (Snakemake, Nextflow). Vous maîtrisez les outils de gestion de versions (Git, CI/CD), les technologies de conteneurisation (Docker, Singularity), les environnements de calcul intensif (HPC) et les langages basés sur SQL ainsi que les bases de données relationnelles (PostgreSQL, MariaDB, MySQL). Une expertise en développement d'API et d'interfaces web (HTML/CSS, PHP, JavaScript) est attendue. Vous êtes capable de concevoir des solutions méthodologiques innovantes, de documenter et diffuser les développements réalisés, d'accompagner des équipes de recherche pluridisciplinaires et de contribuer à la valorisation scientifique des travaux par des publications et des présentations dans des contextes nationaux et internationaux. Vous faites preuve d'autonomie, de rigueur, d'esprit d'initiative et d'excellentes capacités de communication. Une expérience du travail en équipe multidisciplinaire et une aptitude à collaborer avec des chercheurs de différentes disciplines sont indispensables. Vous manifestez un intérêt marqué pour les sciences de l'environnement et les enjeux liés au changement climatique. La maîtrise du français et de l'anglais scientifique, à l'écrit comme à l'oral, est indispensable.

2026-806 - VIA – Chargé de mission Administrateur de base de données F/H

Mon, 17 Aug 2026 08:50:27 Z

Domaine / métier : APPUI - Informatique/E2B44 - Administrateur-trice de bases de données / Intégrateur d'applications
Poste ouvert aux : : Contractuels
Description du poste :
Sous la responsabilité d’un chercheur à l'IRD, vous veillerez à l'intégration des données acquises par les projets passés, en cours, ou à venir. Vos activités seront les suivantes : Prendre part à la consolidation, l’amélioration et la mise en œuvre un plan de gestion des données (PGD / Data Management Plan) couvrant l’ensemble des données produites par le LMI TAPIOCA, en tenant compte des formats variés et des besoins des différentes disciplines ; suivre les formations IRD nécessaires si applicable. Participer à la structuration et le maintien d’ une base de données globale, robuste et fonctionnelle, accessible aux membres du LMI TAPIOCA, reposant sur des outils de gestion simples et éprouvés. Intégrer et documenter les données issues des projets passés, en cours et à venir (ex. biodiversité estuarienne, enquêtes sociologiques, bases historiques), en interaction avec les producteurs de données. Participer à la mise en place des procédures de contrôle qualité et d’autorisation d’accès, en veillant à la cohérence avec les principes de la Science Ouverte. Contribuer à la gestion et la mise à jour de la base dans le Cloud et le dépôt des données dans des référentiels publics (ex. SEANOE), avec attribution de DOI et lien avec HAL. Participer à la rédaction de data papers valorisant les jeux de données. Accompagner et former les contributeurs à l’utilisation des procédures et outils de gestion des données. Votre future équipe Accueilli à l’UFPE (Departamento de Oceanografia), vous interagirez étroitement avec l’UFRPE (Departamento de Pesca e Aquicultura) et d’autres universités brésiliennes. Le LMI TAPIOCA rassemble plus de 150 chercheurs, enseignants-chercheurs et étudiants brésiliens et français. Vous interagirez avec une équipe pluridisciplinaire couvrant l’océanographie physique, la biogéochimie, l’écologie (du plancton aux prédateurs) et les sciences humaines.

Vous avez développé les compétences suivantes : Compréhension de l’architecture et de l’environnement technique des systèmes d’information. Conception, administration et gestion de bases de données, y compris avec des formats et sources variés. Élaboration et mise en œuvre de plans de tests, de sécurité et de procédures garantissant la qualité et la pérennité des données. Notions ou expérience dans la définition d’architectures techniques et dans l’élaboration de plans de gestion des données (Data Management Plans), ou motivation à s’y former rapidement, en lien avec les principes de la Science Ouverte. Aptitude à modéliser et à concevoir des architectures techniques de systèmes d’information, ou volonté de se former à ces pratiques. Capacité à évaluer la pertinence et l’efficacité d’une solution informatique ou de télécommunication. Niveau d’anglais requis : B2. La maîtrise du portugais serait un atout. Vous faites preuve des qualités humaines suivantes : Rigueur dans la rédaction et la mise à jour de la documentation fonctionnelle et technique. Sens de l’organisation et engagement à garantir la qualité et la ponctualité des livrables. Capacité à interagir et à collaborer avec une grande diversité de personnes, aux profils culturels ou scientifiques variés. Vous êtes titulaire d’un diplôme de niveau 7, master ou diplôme d’ingénieur en informatique spécialiste en administration de bases de données.

2026-801 - Ingénieur de recherche en calcul scientifique H/F

Wed, 29 Jul 2026 11:11:16 Z

Domaine / métier : SCIENCE - BAP E : Informatique (scientifique), Statistiques et Calcul scientifique/E1E45 - Expert-e en calcul scientifique
Poste ouvert aux : : Contractuels
Description du poste :
Votre future mission s’inscrit dans le projet BRIDGES-AVATAR qui vise à développer une approche innovante combinant des modèles quantitatifs décrivant les systèmes naturels et socio-économiques et des approches qualitatives plus larges décrivant des contextes socio-économiques et leur gouvernance. Ce projet vise à développer des modélisations du couplage océan-atmosphère de haute résolution et des systèmes socio-écologiques régionaux prenant en compte les besoins humains en ressources naturelles (alimentation, habitats) et les impacts humains sur les écosystèmes marins (pressions liées à la pêche, urbanisation, changement climatique). Sous la responsabilité d'un chercheur de l'IRD, vos activités seront les suivantes : Co-définir les développements de modélisation Lagrangienne à mettre en œuvre en interaction avec les différents projets du programme BRIDGES (en particulier BRIDGES-AVATAR et BRIDGES-RESILIENCE). Concevoir, implémenter et documenter ces développements sur la plateforme Lagrangienne Ichthyop. Garantir la robustesse, la reproductibilité et la performance des développements effectués en environnement de calcul haute performance. Participer à l’animation scientifique du projet BRIDGES-AVATAR autour des approches Lagrangiennes. Assister les utilisateurs de la plateforme Ichthyop issus du programme BRIDGES.

Vous avez développé les compétences suivantes Expertise avancée en calcul scientifique, avec expérience sur les modèles Lagrangiens souhaitée (idéalement Ichthyop). Expertise dans l’utilisation d’outils de gestion de codes (Git, GitHub, GitLab). Solides compétences en programmation (Java, Python) et en environnement de calcul haute performance (HPC). Solides compétences dans l’utilisation d’outils de gestion de données (Zenodo, Sextant, Seanoe). Bonne compréhension des processus océaniques et écologiques et aptitude à les traduire en approches de modélisation robustes et innovantes. Capacité à concevoir, structurer et piloter des systèmes de modélisation complexes. Vous faites preuves des qualités humaines suivantes : Rigueur scientifique et sens de l’organisation, notamment pour garantir la robustesse, la reproductibilité et la pérennité des outils de modélisation. Esprit scientifique solide, avec capacité à comprendre les enjeux de recherche et à contribuer à leur mise en œuvre opérationnelle. Forte capacité à travailler en équipe pluridisciplinaire, en interaction avec modélisateurs et écologistes. Autonomie et sens des responsabilités dans la conduite et la structuration de développements techniques complexes. Capacité à s’inscrire dans un environnement collaboratif et à assurer une communication claire et efficace avec des interlocuteurs scientifiques variés. Vous êtes titulaire d’un diplôme de niveau 7, Master 2, diplôme d’ingénieur dans les domaines de l'informatique, l'océanographie et la modélisation. L’IRD, au cours de votre parcours professionnel, vous accompagne dans le développement de vos compétences. L’institut met à votre disposition un panel d’outils tel que le parcours digital d’intégration, l’accès à la formation permanente, à la promotion et la mobilité. L’IRD offre, en fonction des activités, la possibilité de télétravailler de 1 à 3 jours hebdomadaires. En rejoignant l’IRD, vous bénéficierez : De 32 jours de congés + 13 RTT (pour un temps plein à 38h30 hebdomadaire). Tickets restaurants OU d’une restauration collective (en fonction du site). Souscription annuelle (facultative) à l’Association des Œuvres Sociales : prestations vacances-loisirs et sportives-culturelles. Participation pour la protection sociale.

2026-757 - STAGE - Assitant(e) de projets H/F

Tue, 21 Jul 2026 09:25:07 Z

Domaine / métier : APPUI - Partenariat, valorisation et coopération/J2B44 - Chargé-e d'appui au projet de recherche
Poste ouvert aux : : Contractuels
Description du poste :
Sous la responsabilité d’une cheffe de stage, vous appuierez l’organisation et la mise en œuvre des Trophées de l’innovation : L’IRD organise la 4ème édition des Trophées de l’innovation, un concours visant à récompenser les projets de doctorants et jeunes chercheurs de solutions innovantes et durables en lien avec la recherche de l’IRD. Cette année, le concours portera sur : « Changer le quotidien, bâtir l'avenir - une recherche engagée pour les femmes et les filles ». Vos missions de coordination et d’appui opérationnel : • Appui à la coordination générale et la mise en oeuvre des Trophées (gestion de projet). • Participation à la gestion administrative et logistique du programme : contact avec les partenaires, mobilisation de l’équipe communication, échanges avec les représentations basées à l’international… • Contribution aux différentes phases du concours : sélection des candidatures, conception des parcours d’accompagnement et des formations, préparation de l’événement international de pitch et de la cérémonie de remise des Trophées. • Appui au suivi des lauréat.e.s des éditions précédentes, en lien avec l’incubateur local. • Participation aux activités générales de la Direction (réunions, séminaires, …) « À l’issue de ce stage, vous aurez développé des compétences solides en gestion de projet. Vous aurez également acquis une bonne compréhension de l’innovation en recherche, de ses enjeux et des mécanismes de valorisation et vous serez doté de bonnes connaissances en événementiel. »

Niveau de diplôme préparé : master 2 ou année de césure en gestion de projet, innovation, relations internationales, coopération internationale, ou autres domaines similaires. Compétences attendues : ▪ Maîtrise des outils bureautiques (PackOffice, Google Workspace,Teams…) et de communication (Canva) ▪ Excellentes capacités d’expression, orale et écrite en français et en anglais ▪ Connaissance d’outils de gestion de projet appréciée ▪ Communication interculturelle. Qualités du profil : ▪ Sens de l’organisation ▪ Aptitude au travail en équipe ▪ Esprit d’initiative ▪ Sens de l’écoute ▪ Autonomie